当哈利·波特踏上前往霍格沃茨的路途时，他无意间得知了一个令人震惊的秘密，据传，魔法界里有一座由摄魂怪看守的高-security监狱，名叫阿兹卡班，这里关押着一位名叫小天狼星布莱克的危险犯徒，传言称，布莱克是伏地魔的忠实信徒，也是无情杀人犯，他曾经用一句魔咒连续杀死了十三个人，更令人不安的是，人们说，布莱克不久前从阿兹卡班监狱逃狱，并在霍格沃茨寻找哈利，试图对他发泄仇恨，因为十二年前，布莱克的主人伏地魔曾试图杀害哈利，但不仅没能成功，反而受了重创，据说，布莱克在梦中依然念念有词："他在霍格沃茨……他在霍格沃茨。"
尽管哈利身处霍格沃茨城堡之中,他依然面临着各种威胁，校园里危机四伏，哈利的生命总是岌岌可危，频繁的噩梦让他头痛欲裂，摄魂怪时常在他身边游动，黑魔法防御术课上他甚至当场昏倒，而布莱克的身影也时隐时现。
一天,在霍格沃茨城堡外，布莱克终于与哈利正面相遇，哈利为了替父母报仇，决心与布莱克拼命决斗，布莱克的表现让哈利意想不到——他始终没有对哈利出手，原来，布莱克一直在追杀的并非哈利，而是罗恩的宠物斑斑，斑斑其实是个阿尼马格斯，能够通过魔法变成动物，它的真实身份与布莱克以及新任的黑魔法防御术课老师卢平一样，竟是哈利父母当年的好友——小矮星彼得。
十二年前,因为布莱克轻信小矮星彼得，将哈利父母的下落告诉了他，彼得却背叛了朋友，将他们的行踪卖给了伏地魔，导致哈利父母一同丧生，布莱克既因为自己的过错而内疚，又对彼得的背叛深恶痛绝，他发誓要亲手除掉这个叛徒，卢平逼迫彼得现出了人形，原本是皮毛斑驳的小耗子，通过魔法变成了秃顶的彼得，在哈利面前，彼得终于承认了当年的罪行，哈利、卢平和布莱克商量后，决定将彼得押送霍格沃茨，再转交阿兹卡班。
就在他们准备押送彼得时,意外发生了——彼得再次逃脱，差一点让哈利丧命。